- 1 из 11
- ››
Лаборатория геномики была открыта в январе 2009 года в рамках организации и создания Курчатовского НБИК-Центра и стала первым биологическим подразделением в составе НБИК-Центра. Основными направлениями деятельности Лаборатории являются фундаментальные научные исследования в области геномики, генетической инженерии, биоинформатики и нанобиотехнологий. Кадровый состав Лаборатории был сформирован силами академика РАН К. Г. Скрябина с привлечением научной генетической школы Центра «Биоинженерия» РАН и в настоящее время составляет 7 научных сотрудников — кандидатов наук.
Лаборатория активно сотрудничает и осуществляет совместные проекты с Центром «Биоинженерия» РАН, НИИ канцерогенеза РАМН, Институтом биохимии и генетики Уфимского Научного Центра РАН (г. Уфа), НИИ медицинской генетики СО РАМН (г. Томск), Институтом цитологии и генетики СО РАН (г. Новосибирск), The Centre National de Génotypage (г. Эври, Франция), The International Agency for Research on Cancer (г. Лион, Франция); выполняет конкурсные работы по гранту РФФИ, участвует в международных проектах (The International Cancer Genome Consortium).
В 2009 году сотрудниками Лаборатории геномики было выполнено первое в России полногеномное секвенирование человека. При этом использовались две из представленных на современном рынке технологий — циклическое лигазное секвенирование SOLiD™ (Applied Biosystems) и технология секвенирования на молекулярных кластерах с использованием флуоресцентномеченых предшественников на приборе Genome Analyzer II (Illumina). Был проведен анализ полученных данных, а также установлен оптимальный алгоритм использования новейших методов определения первичной последовательности ДНК при секвенировании индивидуальных геномов человека.
В число научно-исследовательских проектов Лаборатории также входят работы по широкомасштабной генетической характеристике проживающих на территории РФ этносов. В результате взаимодействия с медико-генетическими центрами РФ были определены популяционные группы, представляющие приоритетный интерес для анализа, а также получены биологические образцы для проведения предварительной характеристики генетического материала. Используемые методы, включающие диагностику путем анализа однонуклеотидных полиморфизмов на микрочипах, позволяют получить материал для создания генетической базы данных этносов РФ, что может быть использовано не только для определения этнической группы и последующей идентификации личности, но и для тестирования новых поколений зарубежных лекарственных средств, которые были разработаны и клинически тестированы на других мировых популяциях. Последовательность ДНК генома отдельного человека может быть использована для определения вероятности возникновения генетических заболеваний у него, членов его семьи и в его будущих поколениях.
Технологическая база Лаборатории геномики представлена тремя функциональными блоками:
Молекулярно-биологический блок — содержит оборудование для проведения пробоподготовки (выделение, очистка ДНК, приготовление геномных библиотек);
Блок секвенирования — содержит три секвенатора Genome Analyzer II (Illumina) и два прибора SOLiD™ (Applied Biosystems), а также дополнительное оборудование;
Блок генотипирования — содержит конфокальный сканер iScan (Illumina) c роботизированной станцией загрузки образцов, две автоматизированные системы Tecan и дополнительное оборудование для выполнения стадий пробоподготовки при проведении анализа однонуклеотидных полиморфизмов на микрочипах.